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High Performance Computing / Scientific Computing

Vorbemerkung

  • Für das Hochleistungsrechnen am RRZ der Universität Hamburg steht seit 2009 die neue Ausbaustufe des Linux Clusters basierend auf Intel-Harpertown-CPUs zur Verfügung. Die Benutzung des Parallelrechners setzt eine besondere Zugangsberechtigung in Form einer Projekt-bezogenen Kennung voraus. Bitte lesen sie weitere Informationen hier oder auf unserer internen Kontakt-Seite des HPC / Scientific Computing.

  • Projekte mit sehr hohen Ressourcenanforderungen können im Rahmen des HLRN (Norddeutscher Verbund für Hoch- und Höchstleistungsrechnen) bearbeitet werden. Als lokaler Ansprechpartner fungiert das Rechenzentrum als Schnittstelle zwischen dem HLRN und den Nutzern. Ein Projektantrag auf Benutzung des HLRN-Systems kann direkt beim HLRN über ein Web-Formular gestellt werden.

 

Informationen zum Linuxcluster

Hardware

Der Linuxclusters des RRZ besteht aus:

  • 1 Loginknoten: 2x Intel Xeon E5462 Quad Core, 8x2,80GHz, FSB 1600MHz, 16GB RAM
  • 1 Adminknoten: 1x Intel Xeon L5420 Quad Core, 4x2,50GHz, FSB 1333MHz, 8GB RAM
  • 2 Fileserver : 1x Intel Xeon L5420 Quad Core, 4x2,50GHz, FSB 1333MHz, 8GB RAM
  • 70 Computenodes: 2x Intel Xeon E5462 Quad Core, 8x2,80GHz, FSB 1600MHz, 16GB RAM (Knotentyp c)
  • 14 Computenodes: 2x Intel Xeon E5462 Quad Core, 8x2,80GHz, FSB 1600MHz, 32GB RAM (Knotentyp d)

Netzanbindung, Administrationsnetz: Gigabit Ethernet
Interprozess-Kommunikation: Infiniband DDR 4x

(näheres zur Topologie der Hardware, lesen sie bitte weiter unten unter Batch-System und Scheduler)

Betriebssystem und Konfiguration

SuSE Linux Enterprise 10, Kernel 2.6.16.60-0.21-smp

Für HOME gilt ein Quota von 200GB Softlimit und 250GB Hardlimit.

Batch-System und Scheduler

Auf dem Cluster wird Torque in der Version 2.3.6 als Batchsystem und Maui in der Version 3.2.6p21 als Scheduler eingesetzt. Zur Bedienung des Batch-Systems sehen sie bitte hier, Informationen zur Konfiguration des Schedulers und zum Scheduling-Verhalten sowie zur Hardwaretopologie erhalten sie hier.

Login

Der Loginknoten des Clusters ist weltweit mit der Secure Shell (SSH) über die IP-Adresse 134.100.32.122 oder über den DNS-Alias hpclogin.rrz.uni-hamburg.de zu erreichen.

Status-Seite

Die Status-Seite ist uni-weit abrufbar über http://master.rrz.uni-hamburg.de/hpsc/status.html.

HPC Online-System

Das HPC Online-System ist uni-weit über die Kennung des jeweiligen Benutzers abzufragen und unter folgender Adresse erreichbar:

https://ganymed.rrz.uni-hamburg.de/hpc/

Das System unterstützt derzeit nur rudimentäre Funktionen, wie beispielsweise das Listen User-spezifischer Jobs. Aufgrund der groben (zeitlichen) Granularität werden Jobs mit einer sehr kurzen Laufzeit von nur wenigen Sekunden gar nicht oder nur unregelmäßig erfasst.

Autor: Alexander Fitterling, Stand: 09.06.2010 11:39 Uhr

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