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Das RRZ besitzt eine Gruppenlizenz für Molpro. Das Programm ist in der Version 2010.1 (Patchlevel 13) installiert.
Der Installationspfad ist /G/home/software/molpro2010.
Zum parallelen Rechnen müssen Sie folgende Variablen setzen:
export USE_MPI=yes
export MSG_COMMS=MPI
export TCGRSH=/usr/bin/ssh
export LD_LIBRARY_PATH=/G/home/software/molpro2010/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export PATH=/G/home/software/molpro2010/bin:$PATH
Hier ein Beispiel für einen Batchjob:
####################
#!/bin/bash
#PBS -l walltime=5:00:00,nodes=1:ppn=8:mem16
#PBS -V
cd $HOME/molpro
export TMPDIR=/G/scratch/$USER
cat $PBS_NODEFILE > nodefile1
molpro -n 8 -d $TMPDIR -W $HOME/molpro -o $HOME/molpro/h2.testout $HOME/molpro/h2.com
#####################
#Anmerkung: molpro -n XX gibt die Anzahl der Prozesse an, also bitte an die Anweisung PBS -l anpassen
#PBS -l walltime=5:00:00,ncpus=8
Handbücher und Beispiele sind unter /G/home/software/molpro2010/doc zu finden.
Autor: Elisabeth Kahnert, Stand: 28.02.2011 16:46 Uhr |
