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Das RRZ hat für das Institut für Anorganische und Angewandte Chemie
eine Department Lizenz von TURBOMOLE erworben.
Die aktuell installierte TURBOMOLE-Version ist 6.0.
Der Installationspfad ist (auf dem AMD- wie auch dem Intel-Cluster) /G/home/software/TURBOMOLE.
Auf dem AMD-Cluster sind folgende Variablen in die .profile (.bashrc) aufzunehmen:
TURBODIR=/G/home/software/TURBOMOLE
PATH=$TURBODIR/bin/x86_64-unknown-linux-gnu_mpi:$TURBODIR/scripts:$PATH
PARA_ARCH=MPI
P4_RSHCOMMAND=/usr/bin/rsh
export TURBODIR PATH PARA_ARCH P4_RSHCOMMAND
Auf dem Intel-Cluster sind die Variablen:
export TURBODIR=/G/home/software/TURBOMOLE
export PARA_ARCH=MPI
export P4_RSHCOMMAND=/usr/bin/ssh
export PATH=$TURBODIR/scripts:$PATH
export PATH=$TURBODIR/bin/`sysname`:$PATH
Außerdem braucht man direkt im Jobfile (bitte NICHT in .profile setzen)
die Variable PARNODES, gleich die Anzahl der CPUs, mit denen man rechnen will, z.B.:
export PARNODES=2
Die Dokumentation zu TURBOMOLE liegt im Verzeichnis /G/home/software/TURBOMOLE/DOK.
Zusätzlich ist calculate im Verzeichnis /G/home/software/TURBOMOLE/calculate installiert.
Die Dokumentation dazu befindet sich in demselben Verzeichnis.
Autor: Elisabeth Kahnert, Stand: 01.12.2010 14:24 Uhr |
